L'exploitation doit être un outil pour la formation initiale Elle doit présenter à ce titre une vitrine représentative de la région dans laquelle elle est installée.
Elle doit être un terrain d'expérimentation notamment dans les domaines où sa capacité à être une vitrine attrayante pour le milieu professionnel lui permettra de valoriser ses efforts.
Elle doit être rentable, c'est à dire dégager un excédent qui lui permet de renouveler sinon d'améliorer ses équipements, rembourser ses capitaux empruntés. Elle paie ses salariés sur ses propres recettes, découlant de la vente des ses produits, et des subventions accordées pour les expérimentations

Suite à la construction de nouveaux bâtiments, l'exploitation est à dominante élevage, mais historiquement, il ne faut pas oublier que Flamarens a été un centre expérimental en grandes cultures et possède aussi de grandes cultures céréalières.
Le troupeau laitier est le plus ancien, il date des débuts de l'exploitation avec 25 vaches laitières Prim'holstein.
Le troupeau de vaches allaitantes est plus récent, il a été constitué à partir de lots de génisses achetées jeunes et revendues prêtes à vêler. Il est en cours d'évolution par agrandissement et valorisation vers la production de veaux sous la mère du Lauragais en Label Rouge.
Une exploitation n'a d'intérêt dans un Lycée Agricole que si elle constitue un support pour l'enseignement, un lieu d'expérimentation, et un observatoire (une vitrine) pour les professionnels de l'agriculture de la région.

C'est la raison pour laquelle il a été décidé, à partir de 2007, de la reconstruire totalement.
Cette construction s'est faite sur le site d'En Darassou, financée en partie par le Conseil Régional de Midi Pyrénées et par les fonds propres de l'EPL.
Les bovins-lait ont intégré leur nouvelle étable en février 2008.